دانلود پروژه مقاله پیش بینی مدل سه بعدی آنزیم آمیلاز باکتری Geobacillus stearothermophilus و انجام موتاسیون مجازی به منظور افزایش پایداری حرارتی آن word دارای 3 صفحه می باشد و دارای تنظیمات در microsoft word می باشد و آماده پرینت یا چاپ است
فایل ورد دانلود پروژه مقاله پیش بینی مدل سه بعدی آنزیم آمیلاز باکتری Geobacillus stearothermophilus و انجام موتاسیون مجازی به منظور افزایش پایداری حرارتی آن word کاملا فرمت بندی و تنظیم شده در استاندارد دانشگاه و مراکز دولتی می باشد.
این پروژه توسط مرکز مرکز پروژه های دانشجویی آماده و تنظیم شده است
توجه : در صورت مشاهده بهم ریختگی احتمالی در متون زیر ،دلیل ان کپی کردن این مطالب از داخل فایل ورد می باشد و در فایل اصلی دانلود پروژه مقاله پیش بینی مدل سه بعدی آنزیم آمیلاز باکتری Geobacillus stearothermophilus و انجام موتاسیون مجازی به منظور افزایش پایداری حرارتی آن word ،به هیچ وجه بهم ریختگی وجود ندارد
بخشی از متن دانلود پروژه مقاله پیش بینی مدل سه بعدی آنزیم آمیلاز باکتری Geobacillus stearothermophilus و انجام موتاسیون مجازی به منظور افزایش پایداری حرارتی آن word :
چکیده
Geobacillus stearothermophilus باکتری بسیار ترموفیل است که در در دمای بالای 70œC رشد کرده و آنزیم هایی بسیار
گرمادوست را تولید می کنند. از جمله آنزیم های بسیار گرما دوست تولید شده توسط باکتری های این جنس آمیلاز می باشد که در
صنعت کاربرد فراوانی دارا می باشد. اما صنعت نشاسته نیازمند نوع آنزیمی مقاوم حرارت بالای 85 درجه سانی گراد است در حالیکه
آنزیم طبیعی سویه G.stearothermophilus در این شرایط پایداری مطلوب را ندارد. بنابراین توسعه پایداری حرارتی این آنزیم
مطلوب است. در این مطالعه به منظور افزایش پایداری دمایی آمیلاز ، با استفاده از روش in silico مدل سازی پروتئین انجام شد. مدل سه بعدی مربوط به آمیلاز Geobacillus بوسیله الگوریتم Hiddem Markov Model پیش بینی شد. در پایان تمامی فولدها از طریق Rigid Body Assembly به یکدیگر متصل شده و ساختار کامل ایجاد گردید. سپس مدل پیش بینی شده به عنوان الگو برای الگوریتم PopMusic مورد استفاده قرار گرفت. با استفاده از جهش هدفمند، تغییر در هر جایگاه از جنبه پایداری دمایی اندازه گیری شد.
بر اساس خروجی الگوریتم PopMusic، بهترین موقعیت های جایگزینی شامل موارد زیر می باشند : 188 E به T، 473 K به Eو 476 E به C به ترتیب با افزایش -630، -606 و -541 در پایداری دمایی ابعاد DDG و 263 G به E با تغییر -1009 در ابعاد
.DDG این مطالعه پیشنهاد می کند که جهش های نقطه ای می توانند جهت اهداف آزمایشگاهی با دقت قابل اتکا استفاده شوند. البته تایید این پیش بینی نیازمند تایید کار های عملی است.
واژگان کلیدی: آمیلاز، مقاومت دمایی، جهش زایی
مقدمه
آلفا آمیلاز((E.C3.2.1.1 اغلب متا لوآنزیم هایی هستند که برای تشکیل و ثبات ساختار و فعالیت به یون کلسیم وابسته هستند. این
آنزیم ها به خانواده GH-13 گروه هیدرولاز ها تعلق دارند. آلفا آمیلاز درجانوران، گیاهان ومیکروارگانیسمها وجود دارد. آنزیم آلفا آ میلازقادر به تخریب پیوندهای 4-1 در مولکول آمیلوز بوده ودکسترین شدن در نشاسته را سبب می شود(. (Bordbar,2005
آلفا امیلاز مورد استفاده در صنعت منشا قارچی و باکتریایی دارد. گونههای مختلف جنس Bacillus و آکتینومیستهایی که درمقابل دما
پایدارند مثل B. Thermomonospora و B. Thermoactinomyces برای تولید آلفا امیلاز مناسباند. در این میان B. subtilis، B. polymyxia ، B.mesentericus، B. vulgarus، B.megaterium و B.licheniformis شده اند برای تولید آلفا آمیلاز مورد توجه بوده اند. در حال حاضر، آمیلاز گرمادوست stearothermophilus و یا licheniformis باسیلوس، در صنایع نشاسته استفاده
می شود.
1
